史载：黄巩乃莆阳涵江黄巷村人，明弘治18年（1505）进士，由德安推官入为刑部主事，掌诸司奏牍，历职方武选郎中。
明正德14年春（1519）刘勤余党钱宁、张锐江彬一面与久蓄异谋的宁王宸濠勾结，一面极力怂恿武宗南巡，为了到南京、苏坑湖广寻花问柳、武宗听了奸党意见。朝中大臣坚决谏阻，翰林舒芗（状元），首先联络同僚崔桐等七人联名上疏曰：“陛下大婚十有五年，圣嗣未育，既无太子临朝，又无亲王监国，万一不测，为祸不浅，堪可忧也！且附下两巡西北，人民告祸，今复南巡，恐百姓尽皆逃窜！臣深知言出祸从，顺古则立可显达，但义激于心，为国家和万民计，谨昌死直谏”！丛臣议论纷纷，诚恐祸及走险。
黄巩此时是武选郎中，又是陪正德北巡过他感到舒芬疏稿后尚未尽切，怕皇上不觉悟，又独奏一疏：“如今天下只知有佞幸权臣，而不虑有陛下，宁肯违忤陛下，而不敢稍抗佞幸。祸本已生，陛下尚不知也。待祸变将起，恐陛下知之晓矣！为陛下计，请：（一）崇正学。臣闻圣人主静，君子慎动；（二）广开言路。言路者，国家之命脉也；（三）正名号及纲纪法度，（四）戒游幸；（五）排除佞幸小人。自古未有小人用事，小亡国丧身者也；（六）建储君；此六则并行尚可杜祸。否则，巩国难已急至眉睫！臣自知此言必为奸佞所不容，斥臣为排谤朝政，但臣宁死直言，谏请陛下勿为奸佞所误”。车驾员外郎陆震联名呈进，结果奏疏落入江彬之手，谗言引起正德皇帝大怒，手敕刑部将黄巩陆震等五人下诏狱杖余，罚跪五日，陆震身亡，黄巩万死得生，在打到最后一板时，有杖声而屁股不痛，原来是吕洞宾用拂尘架住责杖，只权到皮不到肉，要不黄巩也就无命了。后被革职为民，回想仙家当初赠龙眼方明“丹墀下见”就应了今日之难。
黄巩罢官回家时，运回十三个纸箱，因他伤口化浓未愈，乡亲们看了又痛又赞叹道：为官多年，真是两袖清风。既为故里，就在村“宗会亭”潜心著述与讲学。
有一次，他坐船去拜访林俊（2部尚书）舟过濠浦西漳村（现郊下村），忽然忆及弱冠时到天花庵避雨住宿，一夜苟题诗于庵内壁上，中有“尘埃不染乾坤静，钵锡生花天地宽”。使他触景生情，登岸重访西漳庵，却觅旧题诗句犹在，感慨不已又题四首绝句，今录其一：“壁间残照半模糊，肯信今吾即故吾。自古浮名俱如此，子虚乌有任称呼”。
从讨中流露了他弃功名，隐退自安的思绪。嘉靖世宗立（1522），召为南京大理丞，未几卒于启初，赠大理寺卿，谥忠裕。后世宗皇帝准奏把上生寺（在卓坡村）两边的立诚书院改为崇忠祠春秋举行官祭，纪念他为官清正坚贞不屈，忠臣不怕死的高风亮节。 （吴春荣）